Características básicas
- En la mayoría de los casos, presentan células móviles gracias a dos flagelos diferentes, uno de ellos es corto, liso y está dirigido hacia atrás, el otro es más largo, dirigido hacia adelante y provisto de pelos tubulares. En algunos casos se observa un solo flagelo que se corresponde con el segundo tipo descrito anteriormente. En otros casos no hay formas flageladas.
- Crestas mitocondriales tubulares.
- Cloroplastos, si están presentes, con 4 membranas envolventes.
Nombres alternativos
Heterokonta (este término significa literalmente: flagelos desiguales).
Grupos incluidos
1. Varios tipos considerados ordinariamente como "algas":
Bacillariophyceaa (= diatomeas)
Chlamydomyxa (ameboide fotofagotrófico)
Chrysophyceae
Dictyochophyceae
Eustigmatophyceae
Phaeophyceae (= "algas" pardas)
Raphidophyceae
Xanthophyceae
2. Nuevos tipos de "algas" descritos en los dos últimos decenios:
Aurearenophyceae
Bolidophyceae
Chrysomerophyceae
Pelagophyceae
Phaeothamnion
Pinguiophyceae
Pleurochloridella
Schizocladiophyceae
Synchroma (ameboide)
Synurophyceae
3. Varios tipos considerados ordinariamente como "hongos":
Hyphochytriales (con un solo flagelo del tipo piloso)
Labyrinthulomycetes
Thraustochytriaceae
Peronosporomycetes (= Oomycetes)
4. Varios tipos de "protozoos":
Actinophryidae (con axópodos)
Bicosoecida (biflagelados)
Blastocystis
Developayella (biflagelado)
Karotomorpha (tetraflagelados)
Leukarachnion (ameboide)
Opalinidae (multiciliados o multiflagelados)
Picophagus (biflagelado)
Pirsonia (parásito biflagelado)
Placidia (flagelado)
Proteromonas (biflagelados)
Wobblia (biflagelado)
Estructura filogenética
No es posible ahora ofrecer un esquema definitivo, sólo apuntar algunas agrupaciones que se vienen repitiendo en los estudios realizados.
Al parecer, todos los Stramenopiles pigmentados (tipo "alga") forman un clado que ha sido denominado Ochrophyta. Las relaciones dentro de este clado no están claras aún por lo que sólo apuntaremos algunos grupos, como el clado PX (llamado también Fucistia). En el resto de los Stramenopiles las cosas tampoco están claras, salvo que no forman un único clado. Se indican algunas de las agrupaciones más probables.
- Ochrophyta
Chrysophyceae (Chrysocapsa, etc.) + Synurophyceae (Synura, Apoikia, etc.)
Leukarachnion + Chlamydomixa + Synchroma
Picophagus
Eustigmatophyceae (Eustigmatos, Nannochloropsis, etc.)
Pinguiophyceae (Pinguichrysis, Phaeomonas, Glossomastix, etc.)
Raphidophyceae (Chattonella, Heterosigma, etc.)
Clado PX (Fucistia)
Chrysomerophyceae (Giraudyopsis, etc.)
Pleurochloridella
Xanthophyceae (Botrydium, Vaucheria, etc.)
Phaeothamnion
Aurearenophyceae (Aurearena)
Schizocladiophyceae (Schizocladia)
Phaeophyceae (Fucus, Sargassum, Ectocarpus, Dictyota, Padina, etc.)
Dictyochophyceae (Dictyocha, Pedinella, etc.) + Pelagophyceae (Aureococcus, Pelagococcus, etc.)
Bacillariophyceae (Phaeodactylum, Odontella, Thalasiossira, etc.) + Bolidophyceae (Bolidomonas)
- Pseudofungi (Cavalier-Smith, 1986)
Peronosporomycetes (Lagenidium, Pythium, Phytophtora, etc.)
Hyphochytriales (Hyphochytrium, Rhizidiomyces, etc.)
Developayella
Pirsonia
- Actinophryidae (= Nucleohelea) (Actinosphaerium, Actinophrys, etc.)
- Opalinata
Blastocystis
Slopalinida (Patterson)
Proteromonas
Karotomorpha
Opalinidae (Protoopalina, Zelleriella, Cepedea, Opalina)
- Placididea (Placidia + Wobblia)
- Bicosoecida (Adriamonas, Filos, Nanos, Siluania, Cafeteria, Bicosoeca, Caecitellus, etc.)
- Labyrinthulomycetes
Amphitremida Poche, 1913 (Diplophrys, Archerella, Amphitrema, Paramphitrema)
Thraustochytrida (Thraustochytrium, Ulkenia, Schizochytrium)
Amphifilidae (Amphilia)
Labyrinthulida (Labyrinthula, Aplanochytrium, Oblongichytrium)
Imágenes
Chrysocapsa (Stramenopiles: Ochrophyta: Chrysophyceae)
Fuente: Protist Information Server (http://protist.i.hosei.ac.jp/PDB/Images/Heterokontophyta/Chrysocapsa/sp_1.html). Autor: Y. Tsukii. Aviso legal: Imagen usada con propósito educativo.

Abajo: Synura (Stramenopiles: Ochrophyta: Synurophyceae)
Fuente: Protist Information Server (http://protist.i.hosei.ac.jp/PDB/Images/Heterokontophyta/Synura/sp_05.htm). Autor: Y. Tsukii. Aviso legal: Imagen usada con propósito educativo.

Abajo: Botrydium (Stramenopiles: Ochrophyta: Fucistia: Xanthophyceae)
Fuente: Phycological Images - Isao Inouye - Institute of Biological Sciences, University of Tsukuba (http://www.biol.tsukuba.ac.jp/~inouye/ino/st/x/Botrydium.GIF). Aviso legal: Imagen usada con propósito educativo.
Abajo: Fucus vesiculosus (Stramenopiles: Ochrophyta: Fucistia: Phaeophyceae)
Fuente: Wikipedia (http://en.wikipedia.org/wiki/Fucus_vesiculosus). Autor: User Stemonitis on en.wikipedia

Abajo: Phaeodactylum tricornutum (Stramenopiles: Ochrophyta: Bacillariophyceae)
Fuente: Bradbury J. (2004-10-12) Nature's Nanotechnologists: Unveiling the Secrets of Diatoms. PLoS Biol 2(10): e306. (http://dx.doi.org/10.1371/journal.pbio.0020306). Autor: Alessandra de Martino and Chris Bowler, Stazione Zoologica and Ecole Normale Supérieure.

Abajo: Opalina ranarum (Stramenopiles: Opalinata: Slopalinida: Opalinidae)
Fuente: Micro*scope (http://starcentral.mbl.edu/microscope/portal.php?pagetitle=assetfactsheet&imageid=9608). Autor: D.J. Patterson.

Abajo: Aplanochytrium (Stramenopiles: Labyrinthulomycetes: Labyrinthulida)
Fuente: The Tree of Life Web Projet (http://tolweb.org/Labyrinthulomycetes/21791). Autor: Celeste Leander.

Abajo: Labyrinthula terrestris (Stramenopiles: Labyrinthulomycetes: Labyrinthulida)
Fuente: The Tree of Life Web Projet (http://tolweb.org/Labyrinthulomycetes/21791). Autor: David Porter.

Abajo: Thraustochytrium (Stramenopiles: Labyrinthulomycetes: Thraustochytrida)
Fuente: The Tree of Life Web Projet (http://tolweb.org/Labyrinthulomycetes/21791). Autor: Celeste Leander.

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